Parafia pw. św. Ojca Pio została erygowana 30.11.2003 r. przez Biskupa łomżyńskiego Stanisława Stefanka. Powstała z terytorium parafii pw. MB Nieustającej Pomocy w Grajewie i pw. Trójcy Przenajświętszej w Grajewie.

W roku 2003 ówczesny proboszcz parafii pw. Trójcy Przenajświętszej w Grajewie ks. prał. dr Czesław Oleksy nabył od miasta teren na Osiedlu Południe 35 wraz z budynkiem dawnego żłobka. Przeprowadzono adaptację budynku na kaplicę i rozpoczęto sprawowanie kultu. Prace adaptacyjne kontynuował pierwszy proboszcz parafii ks. Tomasz Wilga.

W 2012 roku kolejny proboszcz parafii ks. Mariusz Stawierej podjął realizację przybudowy nowego kościoła do istniejącej kaplicy. Dnia 22 września 2013 r. biskup łomżyński Janusz Stepnowski wmurował kamień węgielny pod budującą się świątynię. Świątynia była przebudowywana oraz rozbudowywana według projektu Pani mgr inż. Teresy Chwal z Łomży. W roku 2016 uzyskano stan surowy nowego kościoła. W latach 2016–2023 staraniem aktualnego proboszcza ks. kan. Dariusza Goska przeprowadzono prace wykończeniowe nowej świątyni i jej otoczenia oraz wyposażono kościół przygotowując do uroczystego poświęcenia. Konsekrowany 23 września 2023 r. przez biskupa łomżyńskiego Janusza Stepnowskiego.

Plebania znajduje się w drugiej części budynku byłego żłobka, gdzie również jest wikariat i sale parafialne.

Liczba wiernych: 2930